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舞台は、全国から残念認定された生徒達が集まる高校「茂蔵学園（もぐらがくえん）」。
通称、Z学園に入学した主人公・八乙女 玲は入学早々廃校宣言を告げられる！？
残念過ぎる展開の数々を救う方法はただ１つ……「生徒たちが恋をすること」。

早速、主人公もカップルとなる男子を捜すのだが、
生まれながらにして残念に愛される体質を持つ彼女の周りには、
残念な男子達が次々とやってくる。

しかし全ての人間は不完全で欠けたピースのような存在。
自分の欠けている部分と合う、もう１つのピースがどこかで求めているかもしれない。

たくさんの残念男子の中から1人を選び、あなたの愛を注ぐ事で、
彼らのコンプレックスが解消されたとき、残念(ﾏｲﾅｽ)と残念(ﾏｲﾅｽ)は恋(ﾌﾟﾗｽ)になる。